经典名方调节免疫防治慢病工程研究中心于2024年，由云南省教育厅批准成立，依托云南中医药大学联合相关高校、医院和企业搭建协同创新机制而组建。
工程中心在中医治未病指导下，聚焦经典名方的开发利用，依托经典名方多靶点调节免疫防治慢病的的独特优势，开展疾病发病机制、功能因子靶点和功效机制研究，同时，融合云南特色植物资源创新经典名方配伍，开展中药健康产品创制和关键技术研究。目前已经形成经典名方调节免疫防治高原肺系疾病、调节肠道微环境防治肠道疾病、免疫代谢性疾病的应用基础研究及产品研发3个特色研究方向。中心现有固定研究人员41名，其中正高级职称11人，副高18人；具有博士学历者25人，硕士学历者13人，是一支多学科交叉、具有活力和创新能力的科研队伍。通过持续建设与发展，中心将逐步成为重要的科研人才培育基地，以“现代科技”支撑我校在中医药科研领域地位的不断提升，全面助力中西医结合学科建设和发展，建成重要的中医药产学研一体化平台。